É considerado o mais importante museu sacro do Estado do Rio de Janeiro.
A capela foi construída em 1752 por Baltazar Mendes de Araújo em agradecimento a uma promessa para Nossa Senhora da Lapa. Em 1826 a Irmandade dos Homens Pardos de Nossa Senhora da Boa Morte passa a utilizar a Capela que então recebe o nome de Capela de Nossa Senhora da Lapa e Nossa Senhora da Boa Morte.
É a única igreja católica de Angra dos Reis a possuir a pintura original do retábulo e do altar-mor. Desde 22 de maio de 1992 se tornou o Museu de Arte Sacra, através de Contrato de Comodato com a Mitra Diocesana de Itaguaí. Importante ponto turístico, guarda em seu acervo mais de duas mil peças pertencentes às igrejas, capelas e irmandades de Angra dos Reis. Nos meses de agosto retorna a ser capela para receber as cerimônias religiosas em honra à Nossa Senhora da Boa Morte e Nossa Senhora da Lapa.